超声波金属焊接在其发展过程中也产生了一些弊端这些缺点表现为以下几个方面:
1.结合系统存在问题
超声波金属焊接需要多种协作系统的相互配合，若整个系统的配合度和协调度不一致，就会导致系统在稳定性、可操作性以及可靠性方面存在一定的问题。
2.焊机制造困难且对其机理认识不足。
由于超声波金属焊接技术能够焊接密度大、厚度高的金属以及异种金属，所以对于实现这种技术的焊机的制造要求较高。
3.'开敞性”较差且易出高频振动
超声波金属焊接机“开敞性”比较差，其伸入尺寸被严格限定在焊接所允许的范围内，并且其接头形式仍然只限于搭接接头，还没有在技术上取得进一步的突破。
4.检测困难
对焊接产品质量的检测还是很难做到的，与其配套的检测设备还没有普及，而适用于传统焊接技术的检测方法又无法适用于新技术。